借款协议的有效期通常为三年。依照《中华人民共和国民法典》的规定，民事诉讼的有效期限为自知道或应知权利受损及义务人之日起算的三年。超过此期限未处理的案件，可能会丧失法律的保护。
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关于借条的有效期限问题，通行的做法是依法追索。如果在三年内没有提起诉讼，建议您与借款人协商延长还款期限或者重新签订借条，这样可以中断诉讼时效，确保您的权利得到持续的保护。